Le jeu met en scène les jumeaux Rowan et Lianna, respectivement le prince et la princesse du royaume d'Aytolis, qui ont pour objectif d'empêcher la résurrection du Dragon du Chaos. À leurs côtés, le joueur retrouve des personnages issus d'épisodes précédents de la série Fire Emblem, comme le prince Chrom de Fire Emblem: Awakening et la princesse Camilla de Fire Emblem Fates. Le système de jeu est basé sur celui de Dynasty Warriors, agrémenté des mécaniques de la série Fire Emblem, par exemple le triangle des armes et le système de duos.
